В Университете с 1999 года начали издаваться первые научные журналы – главные составляющие научной литературы, где публиковались ведущие ученые, их аспиранты и докторанты, которые заявляли о себе, подтверждали высокое качество собственных исследований и обсуждали определенную тему с представителями науки. Это журналы: «Астана медициналық журналы», «Валеология», «Оториноларингология және Бас, Мойын хирургиясы».
